Jerusalem, 1191 n. Chr. Es ist der Dritte Kreuzzug. Das Heilige Land steht in Flammen und Blut. Sie schlüpfen in die Rolle von Altaïr, einem Elite-Assassinen, der damit beauftragt ist, den Feindseligkeiten ein Ende zu setzen, indem er sowohl die Kreuzfahrer als auch die Sarazenen bekämpft.
Doch Ihre Aufgabe wird die Zahnräder einer wahren Intrige offenlegen und Sie mitten in einen Konflikt stürzen, der das Heilige Land und den Rest der Welt bedroht.