戦争で引き裂かれ、毒されたニューアースの大気の中で、ローグ・トルーパーは遺伝子兵士であり、生物学的天才クローン部隊の精鋭分隊の一員です。彼らは惑星の過酷な大気を克服し、北部共和国という敵に対して妨げなく戦うために作られました。
クォーツゾーンの虐殺で仲間の裏切りと壊滅を目撃した後、ローグは無断離隊となり、戦友たちを死に追いやった裏切り者を追跡する決意を固めました。
最新の実験的な武器を装備したローグの武器庫は、敵に対して決定的な優位をもたらします。戦死した仲間たちの人格をデジタル化した生体チップが彼の武器、ヘルメット、リュックに格納されており、それぞれが独自の専門知識と支援を提供し、ローグが高度な敵を戦略的に出し抜くことを可能にします。
このゲームは、三人称視点の激しい戦闘と次世代の潜入要素を融合させており、複雑な視線内人工知能、複数の攻略ルート、生体チップ装備の戦術的活用、そして一人用および多人数用のオンラインプレイを特徴としています。