数年後のボリビア。南アメリカのこの美しい国は、世界最大のコカイン生産国となった。影響力が強く暴力的なサンタ・ブランカ組織は国を麻薬国家へと変え、不法行為、恐怖、不正義、犯罪を生み出している。
この組織はマフィアの超大国の地位を手に入れようとしており、世界的な脅威となっている。全面戦争は解決策にはならない。唯一の方法は、慎重かつ致命的な外科手術のような手段で悪の根源を断つことだ。
アメリカの伝説的な特殊部隊「ゴースト隊」が敵地に派遣され、混乱を引き起こし、情勢を不安定にし、最終的には組織と腐敗した政府の同盟を断ち切る任務を負う。
広大で敵対的な環境の中、強大な敵に直面するゴースト隊は、道徳的な葛藤に立ち向かい、困難な戦いを乗り越えて任務を成功させなければならない…それは彼らの歴史上、最も困難で過酷な作戦となる。