Gelegen tussen de gebeurtenissen van Super Metroid en Metroid Fusion, biedt het spel een ongekende toegang tot de achtergrond, gedachten en interacties in het spel van de doorgaans gesloten heldin van de reeks, Samus Aran.
Gezamenlijk ontwikkeld door Nintendo en de beroemde Japanse ontwikkelstudio Team Ninja, biedt het spel ook boeiende speelmogelijkheden, waaronder de mogelijkheid om te schakelen tussen het eerste- en derdepersoonsperspectief, de oriëntatie van de aanwijzer en de Wii-afstandsbediening aan de zijkant, prachtige spelcinematics.
en een klassieke mengeling van Metroid-actie en puzzeloplossend spel.