In de vergiftigde en door oorlog verscheurde atmosfeer van Nu Earth is Rogue Trooper een genetische voetvechter, behorend tot een elite-eenheid van biologisch ontworpen kloontroepen, gemaakt om de vijandige atmosfeer van de planeet te weerstaan, zonder belemmering in hun strijd tegen de vijand, de Noordelijke Republiek.
Na getuige te zijn geweest van het verraad en de vernietiging van zijn team tijdens het bloedbad in de kwartszone, is Rogue voortvluchtig geworden, vastbesloten de verrader op te sporen die zijn strijdmakkers naar de dood heeft gestuurd. Gewapend met de nieuwste experimentele wapens, biedt Rogue’s arsenaal hem een cruciaal voordeel op zijn tegenstanders;
Bioplaatjes met gecodeerde persoonlijkheden van zijn gesneuvelde kameraden zijn opgeslagen in zijn wapen, helm en rugzak, elk met hun unieke deskundigheid en hulp, waardoor Rogue strategisch een geraffineerde vijand kan slim af zijn.
Het spel is een mengeling van intense acties vanuit de derde persoon en nieuwe generatie sluip-elementen, met een complexe kunstmatige intelligentie in het vizier, meerdere speelroutes, een tactisch gebruik van je uitrusting die door bioplaatjes wordt aangestuurd en online spelmogelijkheden zowel solo als in meer spelers.
