Tijdens een speciale missie ontdekte een team van Skylanders een geheime schuilplaats waar Kaos een nieuwe ontdekking aan het uitproberen was – Versteende Duisternis – die hij aanvankelijk wilde gebruiken om een staatsgreep tegen de Skylands te organiseren.
In hun strijd om Kaos te stoppen, ontplofte de schuilplaats en kwam er een wolk van pure Duisternis vrij.
De Skylanders wisten dat ze die niet konden laten ontsnappen, dus absorbeerden ze die energie, waardoor ze donkere versies van zichzelf werden. Gelukkig had Spyro lang geleden geleerd deze duisternis in zichzelf te temmen.
Zo hebben deze Skylanders, met zijn hulp, nu ook geleerd die te beheersen, door zijn kracht te combineren met die van henzelf om Kaos en de machten van het kwaad te bestrijden.
