In een poging om het soort wereldwijde chaos te veroorzaken waar hij altijd van heeft gedroomd, heeft de perverse plankton zijn meest duivelse complot ooit in gang gezet om de wereld te veroveren.
Het lot van Bikini Bottom is in de handen (of kleine tentakels) gelegd van drie argeloze helden. Test je platformvaardigheden als SpongeBob, Patrick of Sandy Cheeks, met een reeks nieuwe manoeuvres en waanzinnige krachtversterkers tot je beschikking.
Verken een enorme 3D-wereld, ontmoet vertrouwde vrienden en zet eindelijk een einde aan Planktons duivelse plan.