Een dodelijk wereldwijde terreurorganisatie bedreigt de mensheid met een uitbraak van het Siphon Filter-virus, en Gabe Logan keert terug om de mensheid te redden in Siphon Filter: The Omega Strain. Het nieuwste deel van de reeks biedt een coöperatieve speelwijze voor vier spelers, evenals 100 dodelijke wapens en werktuigen, gevechten van dichtbij en een verbeterd systeem voor het aanpassen van personages. Gabe kan de wereldbevolking niet alleen redden, dus rekent hij ook op zijn beste nieuwkomers van zijn recent hervormde dienst.
