Ghost Recon Advanced Warfighter 2 est un jeu de tir à la première personne très orienté tactique. Les terroristes tentent un deuxième un coup d'état qui transforme bien vite la ville mexicaine de Juarez, proche de la frontière américaine, en gigantesque zone de guerre. Les Ghosts, des unités d'élite, sont donc sollicitées pour prêter main forte à la population.