Desde tiempos remotos, el Consejo mantiene el equilibrio de la realidad. Los Jinetes son sus brazos armados: se trata de Nephilim (poderosas criaturas nacidas de la unión antinatural entre ángeles y demonios) que juraron lealtad al Consejo y fueron dotados de poderes inconmensurables.
Sin embargo, su historia es trágica: los Jinetes recibieron la orden de usar ese poder para erradicar a su propia especie. Siguió una batalla sangrienta en Edén durante la cual los Jinetes, obedeciendo la voluntad del Consejo, masacraron a los Nephilim.
Aún conmocionados por los acontecimientos de Edén, Guerra y Conflicto reciben una nueva misión: Lucifer, misterioso rey demonio, se prepara para romper el equilibrio otorgando poderes a los señores demonios del Infierno. Guerra y Conflicto deben perseguir a estos demonios, reunir información y desenredar la trama de una conspiración demoníaca que amenaza con perturbar irremediablemente el equilibrio y la misma estructura de la creación.
Darksiders Genesis es un juego de acción y aventura que sumerge al jugador en un mundo donde deberá abrirse paso a través de hordas de demonios, ángeles y todo lo que hay entre ambos para alcanzar el Infierno y salir con vida usando diversas armas de fuego y espadas.
Genesis ofrece a los jugadores una visión del mundo de Darksiders incluso antes de los acontecimientos del juego original, e introduce al Jinete del Apocalipsis Conflicto.