Mankind Divided tiene lugar inmediatamente después del suceso «Incidente Aug», día en que los ciudadanos de todo el mundo que habían recibido aumentos mecánicos perdieron el control de sus mentes y cuerpos, causando la muerte de millones de inocentes.
Ahora estamos en 2029, y la edad dorada de los aumentos ha terminado. Los humanos aumentados mecánicamente son considerados marginados y aislados del resto de la sociedad.
Los crímenes y actos terroristas sirven para encubrir una conspiración mundial destinada a controlar el futuro de la humanidad.