El pantano de Luciérnaga está muriendo y las ranas del Consejo de los Ancianos han pedido a Frogger que lo salve.
Para ello, Frogger debe emprender una agotadora búsqueda para recolectar los elementos sagrados necesarios para mantener vivo el pantano.
Estos elementos fueron robados por el malvado Sr. D y se han repartido en cuatro mundos peligrosos.
Frogger debe viajar a cada mundo para recuperar los elementos robados y vencer a los malvados secuaces del Sr. D. Solo entonces podrá entrar en el Templo de la Rana para enfrentarse al traicionero Sr. D.
