Mario y Luigi muestran su fuerza intestinal: en su complot malvado para tomar el control del reino de los hongos, Fawful engaña a Bowser haciéndole comer un hongo mágico.
El hongo hace que Bowser comience a inhalar todo lo que lo rodea, incluyendo a Mario, Luigi y la princesa Peach. ¿Tendrán los hermanos Mario el valor para salvar a Peach y escapar?
Características del juego:
Los jugadores controlan dos historias distintas. Una representa a Bowser y sus esfuerzos para impedir que un malvado archienemigo tome el control de su castillo.
Paralelamente, dentro de Bowser, los Mario y Luigi del tamaño de un microbio deben abrirse camino a través de los desafíos y mantener la calma si quieren encontrar una forma de salir.
Ellos toman medidas para controlar a Bowser desde dentro, pero sin que él lo sepa. Los jugadores pueden cambiar entre las historias a voluntad.
Lo que sucede dentro de Bowser afecta lo que él hace afuera. A veces, Mario y Luigi deben resolver acertijos y desafíos tras bambalinas para ayudar a Bowser a superar varios obstáculos y avanzar en la trama.
Los jugadores deben presionar los botones en el momento justo para mejorar su desempeño durante las batallas y desafíos.
En algunas batallas, Bowser se vuelve tan grande que los jugadores deben girar su sistema Nintendo DS o Nintendo DSi, soplar en el micrófono o presionar la pantalla táctil con el lápiz para seguir la acción.
El juego presenta el mismo diálogo divertido que ha sido la marca distintiva de la serie Mario y Luigi.
