Situado entre los acontecimientos de Super Metroid y Metroid Fusion, el juego ofrece un acceso sin precedentes al trasfondo, a los pensamientos y a las interacciones dentro del juego de la heroína habitualmente reservada de la serie, Samus Aran.
Desarrollado conjuntamente por Nintendo y el famoso estudio japonés Team Ninja, el juego también ofrece opciones de juego emocionantes, incluyendo la posibilidad de alternar entre las perspectivas en primera persona y en tercera persona, la orientación del puntero y del mando Wii de lado, impresionantes cinemáticas del juego.
y una mezcla clásica de acción Metroid y jugabilidad de resolución de acertijos.