Varios años después del fin de Risen, titanes enfurecidos devastaron el mundo y llevaron a la humanidad al borde de la extinción.
Luego, criaturas monstruosas emergieron de las profundidades del mar y sus ataques detuvieron toda navegación.
El héroe, ahora miembro de la Inquisición, es enviado para descubrir cómo poner fin al caos provocado por estas criaturas de las profundidades.
Su búsqueda comienza con rumores que dicen que los piratas que frecuentan las islas del sur serían los únicos que conocen un modo de deshacerse de las criaturas de una vez por todas y acabar con su reinado de terror.
