Você interpreta Adam Jensen, um especialista em segurança escolhido a dedo para supervisionar a defesa de uma das empresas de biotecnologia mais experimentais da América.
Mas quando uma equipe de operações secretas usa um plano que você criou para capturar e eliminar os cientistas que você foi contratado para proteger, tudo o que você pensava saber sobre seu trabalho muda.
Em uma época em que os avanços científicos transformam regularmente atletas, soldados e espiões em seres superaprimorados, alguém está trabalhando arduamente para garantir que a evolução da humanidade siga um caminho específico, e você precisa descobrir por que as decisões que você toma e as escolhas que faz serão as únicas coisas capazes de mudar isso.