O Pântano Firefly está morrendo e os sapos do Conselho dos Anciãos pediram para Frogger salvá-lo!
Para isso, Frogger deve embarcar em uma jornada exaustiva para coletar os elementos sagrados necessários para manter o pântano vivo.
Esses elementos foram roubados pelo malvado Sr. D e espalhados por quatro mundos perigosos.
Frogger deve viajar por cada mundo para recuperar os elementos roubados e derrotar os malvados capangas do Sr. D. Só então ele poderá entrar no Templo do Sapo para enfrentar o traiçoeiro Sr. D.