Indiana Jones e o Templo da Perdição é um jogo de ação no qual você assume o papel do Professor Jones através de três tipos de fases que se repetem.
A primeira é um jogo de plataformas, enquanto a segunda coloca você em um vagão de mina que deve ser guiado corretamente até a saída. Na terceira fase, você deve recuperar o artefato enquanto evita os inimigos. Depois disso, você repete as mesmas fases, mas que agora apresentam maior complexidade.