Madagascar: Operação Pinguim é uma continuação do jogo Madagascar e apresenta os pinguins do filme como personagens principais.
Seu objetivo é ajudar os animais a escaparem do zoológico do Central Park em Nova York através de túneis subterrâneos. Como um pinguim particular, você usa armas engraçadas para atacar e viajar pelo mundo.
Depois de completar um nível, você abre uma parte de um túnel para os pinguins atravessarem.
O jogo é um jogo de plataforma com rolagem horizontal, principalmente voltado para crianças.
Além de aprender novas habilidades por meio de objetos, seu objetivo também é coletar itens em cada nível.
