Medal of Honor deixa o cenário da Segunda Guerra Mundial pela primeira vez em 11 anos de história e entra no ambiente moderno do Afeganistão dilacerado pela guerra, visto através da perspectiva de um pequeno grupo de personagens fictícios.
Além disso, os jogadores conhecerão o operador de nível 1, um guerreiro de elite e um instrumento relativamente desconhecido do exército americano que atua sob a autoridade do comando nacional, assumindo missões que ninguém mais pode realizar.