30 anos e 32 milhões de cópias vendidas no mundo, o pequeno robô retorna para novas aventuras.
O astuto Dr. Wily está de volta com um novo plano maquiavélico. Felizmente, o Dr. Light, genial inventor do Mega Man, encontrou uma maneira de aumentar as capacidades de seu robô justiceiro com um poderoso protótipo, o "Sistema Duplo de Engrenagens", que permite desacelerar o tempo e carregar o Mega Buster superpoderoso.