Solid Snake retorna em Metal Gear Solid 2: Substance, a edição ampliada de Metal Gear Solid 2: Sons of Liberty, com modos de jogo totalmente novos, personagens ocultos e enredos. A tecnologia de armas ultrassecretas é misteriosamente transportada sob a cobertura de um petroleiro para um destino desconhecido. Cabe a Snake infiltrar-se no transporte e impedir que essa arma mortal de destruição em massa caia em mãos erradas. Você terá muitas maneiras de treinar, pois o jogo oferece mais de 350 missões de realidade virtual além de mais de 15 missões alternativas.