Situado nas semanas que seguem Resistance: Fall of Man, Resistance: Retribuição acompanha a história do ex-fuzileiro naval britânico James Grayson.
Após uma tragédia pessoal, ele é forçado a matar seu próprio irmão dentro de um centro de conversão Chimeran. Grayson embarca em uma vingança para destruir todos os centros de conversão que conseguir encontrar.
Finalmente, Grayson descobre que seus esforços foram em vão. Na Europa Ocidental, os Chimera desenvolveram um novo método para converter humanos em extraterrestres.
A resistência europeia - o Maquis - pede ajuda a Grayson, e ele se une a Cartwright e Parker na operação Overstrike.
A guerra para retomar o continente europeu começou.
