Vários anos após o fim de Risen, titãs enfurecidos devastaram o mundo e levaram a humanidade à beira da extinção.
Em seguida, criaturas monstruosas emergiram das profundezas do mar e seus ataques interromperam toda a navegação.
O herói, agora membro da Inquisição, é enviado para descobrir como pôr fim ao caos causado por essas criaturas das profundezas.
Sua jornada começa com rumores de que os piratas que frequentam as ilhas do sul seriam os únicos a conhecer um meio de se livrar de vez das criaturas e acabar com seu reinado de terror.
